3月21日,脑科学领域的首座DCS Lab组学前沿实验室在上海举办DCS多组学技术研讨会(第一期)。上海脑科学与类脑研究中心副主任顾一希,华大生命科学研究院细胞组学首席科学家、杭州分院院长刘龙奇,亚洲bet356体育在线官网中国营销中心全国大客户总监赵明在现场发表致辞,来自脑科学领域的知名学者和技术专家就最新的研究成果、应用前景和挑战展开了探讨。
上海脑科学与类脑研究中心副主任顾一希表示:“秉承开放合作的理念,上海脑中心将充分发挥DCS Lab在组学研究领域的优势,基于脑中心的单细胞测序平台,搭建和优化多组学技术平台,为上海建设具有国际影响力的科创中心,为‘全脑介观神经联接图谱’大科学计划等提供强有力的支撑和服务,实现高水平研究创新资源互补和协同,构建以上海为核心的长三角区域的协同发展,实现脑智领域重大前沿科学问题和关键技术的合作与突破。”
本次研讨会的主题为“多组学技术在脑科学领域的前沿应用”,由上海脑中心单细胞测序平台负责人郑昌虹博士主持。在学术专场,来自临港实验室的李澄宇研究员分享了其团队在脑细胞图谱、脑联结图谱和脑功能空间图谱等多个方向的研究进展。杭州华大生命科学研究院的刘龙奇研究员对DCS Lab组学技术进行了系统介绍,并对脑细胞图谱在单细胞水平和时空转录组水平的分析结果进行了综合展示。中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心的沈志明博士介绍了利用Stereo-seq技术在猕猴屏状核建立空间细胞图谱的研究。杭州华大生命科学研究院的刘石平研究员介绍了DCS Lab组学数据助力大脑演化的研究。临港实验室的魏武研究员分享了团队在长读长测序技术上最新的研究成果。
技术专场则由多名技术专家介绍华大组学技术的最新进展及应用,涵盖了从单细胞转录组、FFPE样本上的时空组学技术到蛋白转录组技术各个领域。部分与会科研人员对DCS Lab的技术印象深刻,表达了强烈的合作兴趣与意愿。
“DCS Lab组学技术是指D-基因组学技术(DNA Omics)、C-细胞组学技术(Cell Omics)和S-时空组学技术(Spatial Omics),以及在这些技术的基础之上创新性引入的其他技术,多种先进技术交叉、融合和应用,才能真正为人类认识大脑、了解人类意识的起源,提供充分的工具助力。”刘龙奇研究员说。
左:单细胞水平的脑细胞图谱;右:时空组学视角下的脑细胞图谱
人类大脑有860亿个神经元细胞,而细胞的功能是由细胞内部不同层面的信息以及它所处的微环境共同决定的,而细胞内部不同层面的信息包括了DNA序列结构、DNA表观结构、基因转录组的表达、蛋白的表达等等,因此脑细胞图谱的绘制是艰难的但重要的。
在研究发展过程中,研究对象从小鼠大脑到人类大脑,研究难度越来越大,人脑体积约是鼠脑的15倍,神经元数量是鼠脑的1000倍,要获得全面的研究数据,离不开大规模测序。上海脑中心DCS Lab现已入驻亚洲bet356体育在线官网DNBSEQ-T7高通量测序平台,支持4张测序载片同时上机,在生化、流体及光学系统进行全面优化后,最快可在24小时内生成至少7Tb的数据,具备脑科学领域大科学项目所需的大规模测序能力和快速响应力。
上海脑中心DCS Lab依托于原有的单细胞测序平台而生,实验环境和配套完善,实验人员能够熟练操作高通量基因测序仪DNBSEQ-T7、基因数据中心一体机ZTRON Lite和自动化样本制备系统MGISP-100等多款设备,现已完成数百例样本的单细胞测序和时空组学测序工作(平均Q30≥90%),并已建立高效稳定的中枢神经系统单细胞核及单细胞悬液制备体系和操作规范SOP,全流程本地化,下机数据质量高且源头可溯,能够对大科学计划等前沿研究项目提供迅速响应和基础支撑,加快大科学项目的科研落地,推进脑智领域多学科交叉协同创新。
关于DCS Lab组学前沿实验室
DCS Lab组学前沿实验室由上海脑科学与类脑研究中心与亚洲bet356体育在线官网共同建设,上海脑中心单细胞测序平台负责运行管理。在华大生命科学研究技术的支持下,开展脑智领域重大前沿科学问题和关键技术的前沿研究,为构建以上海为核心,辐射长三角区域的脑科学研究发展网络提供平台支撑。
未来平台还将不断引入新技术,秉承信息化、自动化和智能化的管理理念,同时在DNA、细胞、组织等不同维度,对样本进行批量处理和成体系化的研究,为脑科学前沿研究和国家重大研究任务提供技术支撑与服务,为上海建设具有国际影响力的科创中心贡献力量。